中介学校无合理依据扣押毕业证书是违法的，你有权依法维护自己的合法权益。针对此情况，你可以按照以下步骤处理：
一. 明确法律权益
根据《中华人民共和国教育法》第四十三条，学生完成规定的学业后，有权获得相应的学业证书。这是法定权利，任何单位和个人，包括中介学校，都不得侵犯。
二. 了解扣押原因并与中介学校沟通
- 主动沟通：首先，你应主动与中介学校的相关部门沟通，了解扣押毕业证书的具体原因。可能是存在某些未解决的问题，如学费、培训费未结清，或某些毕业手续未完成。
- 记录详情：在沟通过程中，务必做好记录，包括沟通的时间、地点、工作人员姓名及沟通内容，以备后续使用。
- 解决问题：
- 如果是因为费用问题，请仔细核对费用明细，并在经济条件允许的情况下尽快结清。若因经济困难无法及时缴纳，可与中介学校协商制定合理的还款计划，并请求在问题解决后发放毕业证书。
- 如果是因为手续问题，请按照中介学校的要求尽快完成，如有疑问可与相关负责人深入探讨，明确完成标准。
三. 申诉与投诉
- 校内申诉：如果认为中介学校扣押毕业证书没有合理依据，或问题已解决但学校仍拒绝发放，你可以向学校内部的申诉渠道反映情况，并提交详细的申诉材料。
- 教育部门投诉：若校内申诉未能得到满意解决，你可以向当地教育行政部门投诉。投诉时，请准备充分的材料，如沟通记录、费用缴纳凭证、学业完成证明等，以书面形式详细说明情况并提交给教育部门，等待其调查处理。
四. 法律途径
若其他方法都无法解决问题，且你有充分证据证明中介学校扣押毕业证书的行为侵害了你的合法权益，你可以考虑通过法律途径解决：
- 咨询律师：你可以咨询专业律师，获取法律建议和支持。
- 提起诉讼：在律师的指导下，你可以收集相关证据，如沟通记录、学业完成证明等，向法院提起行政诉讼，要求中介学校依法发放毕业证书，并赔偿可能因扣押毕业证书造成的损失。
我建议，在处理此类问题时，务必保持冷静和理性，遵循法律程序，确保自己的权益得到妥善维护。同时，为了预防类似情况再次发生，建议你在选择中介学校时，充分了解其信誉和口碑，避免陷入不必要的法律纠纷。如有进一步需要，您可以继续咨询我。