别人恶意阻止你开公交车上的窗户，并不直接构成对自由权的侵犯。针对这一问题，我们可以从以下几个方面进行分析：

一. 自由权的定义与范畴

• 自由权通常指的是个人在法律规定的范围内，享有行动和思想的自由，不受他人非法干涉的权利。这包括人身自由、言论自由、宗教自由等。
• 公交车上的窗户开关，虽然涉及到乘客的舒适度，但并不直接关联到个人的基本自由权。

二. 行为性质分析

• 恶意阻止开窗户，更多是一种对公共秩序或乘客共同利益的干扰，而非对个人自由权的直接侵犯。
• 如果这种行为导致了其他严重后果，如影响乘客呼吸、造成安全隐患等，可能涉及其他法律责任，如公共安全责任或侵权责任。

三. 相关法律依据

• 根据我国法律，对于公共场所的行为规范，主要依据的是《治安管理处罚法》等相关法律法规，而非直接涉及自由权的法律条款。
• 若该行为构成扰乱公共秩序或侵犯他人合法权益，可依据相关法律进行处罚。

四. 实际处理建议

• 在遇到此类情况时，首先应与阻止者进行沟通，尝试解决分歧。
• 若沟通无果，且行为确实影响了公交车内的正常秩序或乘客权益，可以向公交车司机或管理人员反映情况，寻求帮助。
• 在必要时，也可以报警处理，由警方根据具体情况进行裁决。

综上所述，别人恶意阻止你开公交车上的窗户，并不直接构成对自由权的侵犯。但如果该行为导致了其他不良后果，可能涉及其他法律责任。我的观点是，在处理此类问题时，应优先考虑维护公共秩序和乘客权益，通过合理合法的方式解决分歧。如有进一步需要，您可以继续咨询我。