在商铺租赁合同中，一式两份的合同通常需要在以下几个关键位置按手印以增强合同的法律效力和证明力：

1. 合同首部双方当事人的签字处：

   • 通过在合同首部的签字处按手印，能够更明确地确认双方当事人的身份和签署意愿。这有助于在日后可能出现争议时，证明合同的签署是双方真实意思的表示。

2. 合同约定的重要条款处：

   • 在租赁合同中，诸如租赁期限、租金金额、支付方式、违约责任等关键条款处按手印，可以突出这些条款的重要性，并表明双方对这些条款的明确认可和接受。这有助于防止日后对条款内容的否认或误解。

3. 合同的末尾处：

   • 在双方确认合同内容无误后，可以在合同的末尾处按手印，以表示对整个合同的最终确认和接受。这相当于对合同整体内容的一个总结性认可。

在按手印时，应确保手印清晰、完整，并且与签字一样具有同等的法律效力。模糊或重叠的手印可能会影响其法律效力，因此在按手印时应仔细操作。

总的来说，商铺租赁合同一式两份中，按手印的位置应选择在能够明确表明双方身份、意愿以及对合同内容认可的关键位置。这样做可以更好地保障合同双方的合法权益，减少日后可能出现的争议和纠纷。