个税上在两个公司有影响，但与其中一个公司走仲裁并无直接关联。下面我详细解释一下这个结论：

首先，从个税的角度来看，如果你在两个公司都有收入，那么你需要分别向这两个公司所在地的税务机关申报个税。这意味着，你的个税缴纳情况是基于你在每个公司的收入来确定的，与是否和其中一个公司走仲裁程序无关。

其次，仲裁程序通常用于解决公司与员工之间的劳动争议或其他合同纠纷。如果你与其中一个公司发生了争议，并选择了仲裁作为解决方式，那么仲裁的结果可能会涉及到你与该公司的经济关系，比如赔偿、工资支付等。但这些仲裁结果并不会直接影响你在个税上的缴纳情况，除非仲裁结果导致了你的收入发生变化，进而影响了你的个税缴纳基数。

综上所述，个税上在两个公司有影响，但这与是否和其中一个公司走仲裁程序没有直接关联。如果你对个税缴纳或仲裁程序有任何疑问，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况给出更详细的解答。