关于“协议一式六份，编号是否和第一份保持一致”的问题，结论是需要根据具体情况来确定，以下是对此问题的详细分析：

1. 如果协议中明确规定了编号规则：

   • 在这种情况下，应严格按照协议中规定的编号规则来执行。如果协议中明确指出所有副本的编号应与第一份保持一致，那么就必须这样做。这样的规定通常是为了确保协议的一致性和可追溯性。

2. 如果协议中未明确规定编号规则：

   • 当协议中没有明确规定编号规则时，编号的方式就可以更加灵活。但出于管理和追踪的便利性考虑，通常建议所有副本的编号保持一致，或者采用一种能够清晰区分不同副本但又不失关联性的编号方式。
   • 另一种做法是，每份副本都独立编号，但同时在协议中或附件中明确记录各份副本的编号及对应关系，以确保在需要时能够迅速找到对应的副本。

3. 实际操作中的考虑：

   • 在实际操作中，除了编号的一致性外，还需要关注协议的其他内容是否一致，如条款、签字、盖章等。这些都是影响协议有效性的关键因素。
   • 此外，还应考虑协议的管理和存储方式。如果协议副本较多，且需要频繁查阅或归档，那么采用一种统一且易于管理的编号方式将显得尤为重要。

综上所述，协议一式六份的编号是否与第一份保持一致，取决于协议中的具体规定以及实际操作中的需要。如果协议中有明确规定，则应严格遵守；如果协议中未明确规定，则应根据实际情况和管理需求来灵活处理。如有任何疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。