夫妻双方在不同城市工作生活，不能分别填报租房扣除。根据《国务院关于印发个人所得税专项附加扣除暂行办法的通知》（国发〔2018〕41号）第二十条的规定，纳税人及其配偶在一个纳税年度内不能同时分别享受住房贷款利息和住房租金专项附加扣除。这意味着，夫妻二人在同一纳税年度内，对于住房贷款利息和住房租金专项附加扣除，只能选择其中一项进行享受。具体来说，你们有以下三种符合规定的扣除方法：

1. 妻子享受住房贷款利息专项附加扣除，丈夫则不能享受住房贷款利息和住房租金专项附加扣除。
2. 丈夫享受住房租金专项附加扣除，妻子则不能享受住房贷款利息和住房租金专项附加扣除。
3. 丈夫享受住房贷款利息专项附加扣除，妻子则不能享受住房贷款利息和住房租金专项附加扣除。

你们可以根据自己的实际情况，选择其中一种最优的方式进行扣除。如有进一步需要，您可以继续咨询我。