当主犯认罪而从犯不认罪时，法院的判决会综合多方面因素进行细致考量，以确保司法的公正性和权威性。

首先，对于主犯来说，其认罪态度通常会被视为一个重要的量刑情节。如果主犯能够如实供述自己的罪行，根据法律规定，这通常可以作为从轻处罚的依据。在某些情况下，如果主犯的如实供述避免了特别严重后果的发生，甚至还可以减轻处罚。司法机关在量刑时，会综合考虑主犯所犯罪行的性质、情节、危害后果，以及认罪这一情节，从而在法定刑幅度内确定一个具体的刑罚。

而对于从犯，即便其不认罪，司法机关也会依据在案的各种证据来严谨地认定其是否构成犯罪，以及在共同犯罪中扮演的角色和所起的作用。这些证据包括但不限于物证、书证、证人证言等。如果从犯的犯罪行为被证据确实、充分地证明，且其在共同犯罪中起的是次要或辅助作用，那么司法机关依然会按照从犯的规定进行处罚。通常情况下，从犯因为其在共同犯罪中的次要或辅助角色，会从轻、减轻处罚，或者在某些情况下甚至可能被免除处罚。

值得一提的是，无论是主犯还是从犯，法院在判决时都会严格遵循“以事实为依据、以法律为准绳”的原则。这意味着判决不会仅仅因为一方认罪而另一方不认罪就偏离法律规定，而是会确保罪责刑相适应，即刑罚的轻重与犯罪分子的罪行和应承担的刑事责任相适应。

总的来说，当主犯认罪而从犯不认罪时，法院的判决会综合考虑各种因素，包括犯罪的性质、情节、社会危害程度，以及主犯和从犯在共同犯罪中的具体作用和认罪态度等。通过这样的综合考量，法院能够确保对每个犯罪分子都做出公正、公平的判决。