抵押期限过了，抵押权人与抵押人通过签订还款协议，一般不需要重新进行抵押登记。下面我来详细解释一下：
首先，我们要明确抵押登记的作用。抵押登记主要是为了保障抵押权的设立和优先受偿权。在抵押权设立时，通过登记将抵押物的权利状态公示出来，以确保抵押权的合法性和有效性。
现在，你提到的是抵押期限已经过了，但抵押权人与抵押人之间又签订了还款协议。这种情况下，我们主要关注的是还款协议是否改变了原有的抵押关系。
如果还款协议只是对原有债务的偿还方式和时间进行了约定，并没有改变抵押物的状态或抵押权的性质，那么原有的抵押登记仍然有效。因为抵押权并没有因为还款协议的签订而消灭或转移，所以不需要重新进行抵押登记。
如果还款协议中涉及到了抵押物的变更、替换或者抵押权的转移等新的情况，那么就需要根据新的情况来判断是否需要重新进行抵押登记。比如，如果协议中约定了新的抵押物，那么就需要对新抵押物进行登记；如果抵押权转移给了新的债权人，那么也需要进行相应的变更登记。
但在你描述的情况中，只是提到了签订还款协议，并没有提到上述需要变更登记的情况。所以，我们可以推断，在这种情况下，一般不需要重新进行抵押登记。
当然，具体是否需要重新登记，还需要根据还款协议的具体内容以及当地的法律法规来判断。如果你手上有具体的还款协议，或者对当地的法律法规有疑问，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况给出更准确的建议。