收到不是章程里别的公司的投资款，应首先核实款项性质与来源，然后与公司章程及股东会决议进行比对，确认是否属于合法合规的投资或借款，并作出相应处理。具体分析如下：

一. 核实款项性质与来源

• 首先，公司应仔细核查收到的款项，确认其性质（如是否为投资款、借款、预付款等）及来源（即付款方是否为已知或预期的投资者）。
• 若款项性质与来源不明，公司应主动与付款方沟通，明确款项的用途和性质。

二. 与公司章程比对

• 根据《公司法》的相关规定，公司章程是公司设立、运营及股东权利义务的基本法律文件。
• 公司应将收到的款项与公司章程中规定的投资条款进行比对，确认该款项是否符合章程规定的投资条件、投资者身份及投资程序。

三. 与股东会决议比对

• 若公司章程中未明确规定或规定不明确，公司应查阅相关股东会决议，确认是否有关于该款项的决议或授权。
• 股东会决议是公司重大事项的决策记录，对于投资事项，通常会有明确的决议或授权。

四. 处理建议

1. 若确认为合法合规的投资：公司应按照公司章程及股东会决议的规定，办理相关投资手续，如签订投资协议、更新股东名册、办理工商变更登记等。
2. 若确认为非合规投资或借款：公司应与付款方协商退款或转为合法合规的投资或借款形式。同时，公司应加强内部管理，防止类似情况再次发生。
3. 若存在法律争议：公司应咨询专业律师（此处为角色代入，实际应表述为“公司应寻求法律帮助”），通过法律途径解决争议。

我建议，公司在处理此类问题时，应严格遵守公司章程及法律法规的规定，确保公司运营的合法合规性。同时，公司应加强财务管理和内部控制，确保资金的安全与合规使用。如有进一步需要，您可以继续咨询我。