农商房贷还款20号17点后存入，如果银行未进行扣款，则可能会产生逾期。具体分析如下：

一般来说，银行房贷的扣款时间是在还款日当天，但具体的扣款时间点可能因银行而异。对于农商银行而言，其可能在还款日的某个时间点（如17点）进行扣款。如果借款人在此时间点之后存入还款金额，而银行未进行二次扣款，那么该笔还款就可能被视为逾期。

为了避免这种情况，建议借款人：

1. 提前存入还款金额：确保在还款日之前或当天银行扣款时间点之前，将足够的还款金额存入扣款账户。
2. 关注银行扣款通知：及时关注银行的扣款通知或短信提醒，了解扣款是否成功。
3. 咨询银行客服：如果不确定扣款时间或存入时间是否会影响还款，可以及时联系银行客服进行咨询。

总之，为了确保房贷还款的及时性，借款人应提前了解银行的扣款规定，并合理安排还款时间。如果因特殊原因导致还款逾期，应及时与银行沟通并尽快补齐还款，以减少对个人征信的影响。