结论：农业银行房贷还款日当天24点前存入一般不算逾期，但需结合具体还款方式、银行系统处理规则及合同约定综合判断。以下从不同角度展开分析：

1. 还款日截止时间的法律与行业惯例

根据《商业银行个人住房贷款管理办法》及银行业通用规则，房贷还款日通常以银行系统记录的到账时间为准，而非借款人操作时间。若合同未明确约定具体截止时间（如“还款日17:00前”），则默认以当日24:00前为有效还款期限。因此，若在还款日当天24点前完成存款操作，且银行系统最终成功扣款，一般不构成逾期。

例外情形：

• 若合同中明确约定了更早的截止时间（如“还款日16:00前”），则需以合同约定为准；
  
• 若存款操作因银行系统延迟（如跨行转账、节假日清算等）导致实际到账时间超过还款日，可能被认定为逾期。

2. 还款方式的影响

• 自动扣款（关联账户）：若借款人授权银行从关联账户自动扣款，需确保还款日当天账户内余额充足。银行通常会在还款日当天多次尝试扣款（如早晨、下午、晚上），若最后一次扣款成功（即使接近24:00），一般不算逾期。
  
• 主动还款（柜台/网银/手机银行）：若借款人通过柜台、网银或手机银行主动还款，需以银行系统实际处理时间为准。若在还款日24点前完成操作且系统显示“还款成功”，则不构成逾期；若因系统故障导致还款失败，需及时联系银行并提供凭证（如转账记录）申请撤销逾期记录。

3. 合同条款的优先性

房贷合同是判断是否逾期的核心依据。若合同中明确约定了还款日的截止时间（如“还款日18:00前”），则需严格遵守；若合同未明确约定，则以行业惯例（24:00前）为准。建议借款人仔细阅读合同条款，或联系农业银行客服确认具体规则。

4. 逾期后果与应对建议

• 逾期后果：若被认定为逾期，银行可能收取罚息、上报征信记录，甚至影响后续贷款申请。
  
• 应对建议：
  
  1. 提前1-2天将还款金额存入关联账户，避免因系统延迟导致逾期；
     
  2. 若因特殊原因无法按时还款，及时联系银行申请延期或分期还款；
     
  3. 保留还款凭证（如转账记录、短信通知），以便在发生争议时维权。

总结：农业银行房贷还款日当天24点前存入一般不算逾期，但需结合合同约定、还款方式及银行系统处理规则综合判断。若有疑问，建议直接联系农业银行客服或通过官方渠道确认具体规则，避免因信息误差导致不必要的损失。