结论：农行贷款一天后存入是否会逾期，需分情况讨论，关键在于贷款合同约定的还款时间节点及银行扣款规则。

1. 若贷款合同明确约定还款日为固定日期（如每月5日），且银行在还款日当天已发起自动扣款但账户余额不足
   根据《民法典》第六百七十五条，借款人应按约定期限返还借款。若还款日当天银行扣款时账户余额不足，即使次日存入，仍可能被认定为逾期。因为逾期判断以“约定还款日是否足额还款”为标准，而非实际到账时间。此时银行可能收取罚息，并影响个人征信记录。

2. 若贷款合同约定还款方式为“主动还款”且未明确具体扣款时间
   若借款人需在还款日当天或之前手动操作还款（如通过网银、手机银行转账），则只要在还款日24:00前完成转账并到账，即视为按时还款。若次日才存入，则属于逾期，银行有权按合同约定追究违约责任。

3. 若银行提供“宽限期”服务（需以合同约定为准）
   部分银行对部分贷款产品提供1-3天的还款宽限期（如农行“网捷贷”可能提供宽限期）。若在宽限期内补足还款，通常不视为逾期。但需注意：

   • 宽限期非法定权利，需以贷款合同明确约定为准；
     
   • 即使有宽限期，银行仍可能收取少量滞纳金或利息。

建议行动：

1. 立即查看贷款合同：重点核对“还款方式”“还款日”“逾期定义”等条款；
   
2. 联系农行客服：确认该笔贷款是否享有宽限期，及当前还款状态是否已更新；
   
3. 保留证据：若因银行系统问题导致扣款失败（如还款日当天账户余额充足但未扣款），需保存转账记录、账户流水等证据，以备后续维权。
   

温馨提示：逾期还款可能影响个人征信，建议提前1-2天确保账户余额充足，避免因跨行转账延迟、节假日清算等问题导致意外逾期。如有其他贷款法律问题，欢迎随时向我咨询。