关于工伤认定补正材料上传的问题，根据相关规定和流程，以下是详细的解答：

在工伤认定申请过程中，如果申请人提交的材料不完整，社会保险行政部门会以书面形式一次性告知申请人需要补正的全部材料。这时，申请人需要按照要求，将缺失的材料进行补正并上传。

具体来说，补正材料上传的步骤如下：

1. 登录工伤认定申请系统，找到“工伤认定补正材料”相关选项。
2. 在业务状态中选择“资料补齐补正”。
3. 输入受伤职工的身份证号码，点击查询以确认需要补正的材料。
4. 点击“附件上传”，将需要补正的材料逐一上传。请确保上传的材料清晰、完整，并且符合社会保险行政部门的要求。
5. 上传完毕后，点击“确认申请”。此时，系统会显示确认通过或者已申请待受理的状态，表示补正材料已经成功提交。

关于是全部上传还是只上传缺失的部分，根据实际操作流程，申请人只需要上传缺失的或需要补正的部分材料即可。不需要将已经提交过的、无需补正的材料再次上传。

此外，申请人还需要注意以下几点：

1. 密切关注工伤认定申请的进度，以便及时了解到是否需要补正材料以及补正材料是否已经被受理。
2. 如果对工伤认定决定不服，可以依法申请行政复议或者提起行政诉讼。
3. 工伤认定结束后，相关的资料会被社会保险行政部门保存一定期限，申请人无需担心资料丢失的问题。

综上所述，工伤认定补正材料上传时，只需上传缺失或需要补正的部分，并按照规定的步骤进行操作即可。希望这个解答能够帮助您更好地了解工伤认定补正材料的上传流程。