逾期9000元，违约金1000元是否违法，取决于合同的具体约定以及相关法律法规的规定。下面我将从几个方面进行详细分析：

1. 合同约定：

   • 如果合同中明确规定了逾期付款需要支付1000元作为违约金，并且该约定不违反法律法规的强制性规定，那么这种约定是有效的，违约金1000元不违法。
   • 如果合同中没有明确约定违约金数额或计算方式，或者约定不明确，那么违约金的确定就需要依据相关法律法规或司法解释的规定。

2. 法律法规规定：

   • 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，当事人可以约定一方违约时应当根据违约情况向对方支付一定数额的违约金，也可以约定因违约产生的损失赔偿额的计算方法。
   • 但是，约定的违约金过分高于造成的损失的，人民法院或者仲裁机构可以根据当事人的请求予以适当减少。

3. 实际损失与违约金的关系：

   • 如果逾期9000元给守约方造成的实际损失远大于1000元，且1000元的违约金并不足以弥补守约方的损失，那么守约方有权要求违约方支付更多的违约金或赔偿损失。
   • 如果逾期9000元给守约方造成的实际损失较小，甚至没有损失，而约定的违约金为1000元，那么这可能会被视为约定的违约金过分高于造成的损失，违约方有权请求人民法院或者仲裁机构予以适当减少。

综上所述，逾期9000元，违约金1000元是否违法，需要具体看合同中的约定以及实际损失情况。如果合同中有明确且有效的约定，并且违约金数额不过分高于实际损失，那么这种约定是合法的。如果合同中没有明确约定或约定不明确，或者违约金数额过分高于实际损失，那么就需要依据相关法律法规或司法解释的规定来确定违约金的数额。如果你有更具体的情况或合同内容，我可以为你提供更详细的法律分析和建议。