土地闲置被政府收回后，原拆迁协议的权利义务并不自动由新拿到土地的企业承继。以下是详细分析：

1. 法律原则：

   • 根据合同相对性原则，原拆迁协议是拆迁人与被拆迁人之间基于特定条件、特定目的而订立的，其权利和义务仅对合同双方具有约束力。
   • 当土地被政府收回并重新出让给新企业时，原拆迁协议并不因此自动转移或承继给新企业。

2. 政府收回土地的法律后果：

   • 政府收回土地通常基于公共利益或城市规划等需要，这一行为会导致原土地使用权人丧失土地使用权。
   • 原拆迁协议中涉及的土地使用权部分将因政府收回而终止或需要重新协商。

3. 新企业获取土地的方式：

   • 新企业通过招拍挂或其他合法方式获取土地，其获取的是土地的使用权，而非原拆迁协议中的权利和义务。
   • 新企业若需涉及原拆迁协议中的事项，应与相关方重新协商并签订新的协议。

4. 实践中的处理：

   • 在实际操作中，若原拆迁协议中的权利义务对新企业有重要影响，新企业应在获取土地前与政府或原拆迁协议的相关方进行充分沟通。
   • 双方可协商是否将原拆迁协议中的部分或全部权利义务转让给新企业，并签订相应的转让协议。

综上所述，土地闲置被政府收回后，原拆迁协议的权利义务并不自动由新拿到土地的企业承继。新企业若需涉及原拆迁协议中的事项，应与相关方重新协商并签订新的协议。如有进一步疑问或需要法律帮助，请直接向我咨询。