对于违法广告牌的建设主体无法查明的情况，应首先由城市人民政府市容环境卫生行政主管部门或者其委托的单位责令停止违法行为，限期清理、拆除或者采取其他补救措施，并依据相关法规进行处罚；若无法确定具体责任人，则可能需要对广告牌进行强制拆除，并通过公告等方式寻找违法者，同时保留追究其法律责任的权利。
一. 处理流程与责任
责令停止与限期处理：
- 根据《城市市容和环境卫生管理条例》第三十六条，对于擅自设置大型户外广告，影响市容的行为，由城市人民政府市容环境卫生行政主管部门或者其委托的单位责令其停止违法行为，限期清理、拆除或者采取其他补救措施。这一规定同样适用于违法广告牌的建设主体无法查明的情况。
处罚与强制拆除：
- 若违法广告牌的建设主体无法查明，但违法行为确实存在，相关部门应依据《内蒙古自治区城市市容和环境卫生违法行为处罚规定》第五条，对擅自设置大型户外广告标牌设施的行为进行处罚，尽管此时可能无法直接对建设主体进行罚款。
- 在无法确定具体责任人的情况下，为了维护市容和环境卫生，相关部门可能需要对广告牌进行强制拆除。
公告寻找违法者：
- 拆除后，相关部门可以通过公告等方式尝试寻找违法广告牌的建设主体，并要求其承担相应的法律责任。
保留追究权利：
- 即使暂时无法查明建设主体，相关部门也应保留追究其法律责任的权利，一旦查明，应依法进行处理。
二. 实际操作中的考虑
- 在实际操作中，对于无法查明建设主体的违法广告牌，相关部门可能会面临一定的执法难度。但为了维护市容和环境卫生，仍需依法进行处理，包括责令停止违法行为、限期清理或拆除等。
- 同时，相关部门也应加强监管和巡查力度，及时发现并处理类似违法行为，以维护城市形象和市民的生活环境。
我建议：对于无法查明建设主体的违法广告牌，相关部门应依法进行处理，并加强监管和巡查力度，以预防类似违法行为的再次发生。同时，市民也应积极参与城市管理工作，发现违法行为及时举报，共同维护城市的美好环境。如有进一步需要，您可以继续咨询我。