针对您提出的问题，关于“行驶证上是单位名字，而签订卖车协议是个人，起诉时以谁的名义起诉”，以下是我的详细解答：
结论：起诉时，应以卖车协议上的签约方作为起诉的主体，即以个人名义起诉，但同时需考虑单位与实际车主之间的关系，以及是否存在表见代理等情形。
分析说明：
卖车协议的主体：
- 卖车协议是买卖双方就车辆买卖事宜达成的书面约定，其上的签约方即为协议的主体。
- 在您的情况中，卖车协议上签订的是个人名字，因此，从协议的角度来看，个人是卖车行为的直接参与者，也是承担协议义务和享受协议权利的主体。
行驶证上的单位名字：
- 行驶证是车辆合法上路行驶的凭证，其上登记的是车辆的所有权人。
- 行驶证上登记为单位名字，可能意味着车辆的所有权属于该单位，或者单位对车辆有某种管理权或使用权。
起诉主体的确定：
- 当卖车协议发生纠纷，需要起诉时，应以协议上的签约方作为起诉的主体。
- 如果单位对车辆有所有权或管理权，并且与卖车行为有直接关联，那么单位也可能成为诉讼的参与方，但这不是基于行驶证上的登记，而是基于其与卖车行为之间的实际法律关系。
特殊情况的处理：
- 如果存在表见代理等情形，即个人以单位的名义签订卖车协议，但实际上并未获得单位的授权或追认，那么起诉时可能需要考虑单位与个人之间的法律关系，以及个人是否应承担相应的法律责任。
法律建议：
- 在起诉前，建议您先收集并整理好卖车协议、行驶证、车辆交易凭证等相关证据材料。
- 根据具体情况，分析并确定起诉的主体和诉讼请求。
- 如果您对诉讼程序或法律条款不熟悉，建议咨询专业律师，以获取更准确的法律建议和帮助。
综上所述，起诉时应以卖车协议上的签约方作为起诉的主体，即以个人名义起诉。但同时，您也需要考虑单位与实际车主之间的关系，以及是否存在其他特殊情况，以便更准确地确定诉讼策略。