当公司股权被法院拍卖时，股东可以通过以下方式来维护自己的权益：

一、确认拍卖的合法性与合规性

首先，股东应仔细审查拍卖程序是否符合《拍卖法》及相关法律法规的规定。这包括但不限于拍卖是否提前进行了公告、拍卖机构是否具备相应的资质等。如果发现拍卖程序存在违法行为，股东有权向法院或相关监管部门提出异议，并要求纠正。

二、行使优先购买权

对于有限责任公司，股东在股权拍卖中通常享有优先购买权。股东应密切关注拍卖公告，并在规定的时间内行使自己的优先购买权。如果决定行使优先购买权，需按照拍卖规定的条件支付相应的价款。若放弃优先购买权，则应配合拍卖程序的进行。

三、查看股权来源及争议情况

股东应仔细核查被拍卖股权的来源及是否存在权属争议。如果股权存在权属不清或有其他争议，并且公司有充分的证据，股东可以通过向法院提起确权之诉来请求确认股权的归属，并有可能中止拍卖程序。

四、协商与诉讼

1. 与债权人协商：如果公司因经营困难导致股权被拍卖以偿债，股东可以考虑与债权人进行协商，达成债务重组协议，请求债权人撤回拍卖申请，通过其他方式解决债务问题。

2. 法律诉讼：在拍卖完成后，如果原股东认为自己的权益受到了侵害，例如拍卖价格过低导致损失，或者拍卖程序存在瑕疵，可以通过法律途径来维护自己的合法权益。这包括向法院提起诉讼，要求赔偿损失或确认拍卖无效等。

五、关注拍卖后的股权变更手续

在股权拍卖成交后，买受人与拍卖机构会签订成交确认书并支付款项。随后，会办理股权变更登记手续，包括修改公司章程、股东名册等。原股东应密切关注这些变更手续的进行，确保自己的权益得到妥善处理。

综上所述，当公司股权被法院拍卖时，股东应通过确认拍卖的合法性与合规性、行使优先购买权、查看股权来源及争议情况、协商与诉讼以及关注拍卖后的股权变更手续等方式来维护自己的权益。在整个过程中，股东应保持冷静和理性，依法行事，以最大程度地保护自己的合法权益。