被铁路运输部门起诉，通常是因为涉及到了铁路运输相关的法律纠纷。这类纠纷可能涵盖多个方面，比如票务问题、货物运输损坏、铁路安全事故责任等。下面我将分情况详细解析可能的原因：
票务纠纷：
- 如果你作为乘客，未按照规定购买车票或者使用了假票、废票乘车，根据《中华人民共和国铁路法》及相关规定，铁路运输部门有权向你追讨票款，并可能通过法律途径解决纠纷。
- 例如，你通过非正常渠道获取了优惠票或者逃票，铁路运输部门在查实后，有权要求你补缴票款，并可能提起诉讼。
货物运输损坏：
- 如果你作为托运人或者收货人，在铁路运输过程中货物发生了损坏或者灭失，且双方对赔偿事宜无法达成一致，铁路运输部门可能会选择通过法律手段来解决争议。
- 例如，你托运了一批易碎品，但由于包装不当或者运输过程中的颠簸导致货物损坏，铁路运输部门在认为自身无过错或赔偿金额有争议时，可能会提起诉讼。
铁路安全事故责任：
- 如果在铁路运输过程中发生了安全事故，如列车脱轨、碰撞等，且事故责任与你有关，铁路运输部门可能会向你追究法律责任。
- 例如，你作为行人或者车辆驾驶员，违反了铁路交通规则，导致与列车发生碰撞事故，铁路运输部门在认定你承担部分或全部责任后，可能会提起诉讼要求赔偿。
我建议：首先，你需要仔细查看铁路运输部门提起的诉讼文书，明确纠纷的具体内容和诉讼请求。然后，根据纠纷的性质和事实情况，准备相应的证据材料来支持你的抗辩。如果你对法律程序不熟悉，或者认为纠纷较为复杂，可以聘请专业的律师来为你提供法律帮助。如有进一步需要，您可以继续咨询我。