针对您提出的“运输合同纠纷案件被异地起诉怎么办”的问题，以下是我为您提供的详细解答：
一、明确管辖法院原则
首先，您需要了解运输合同纠纷的管辖法院确定原则。根据《民事诉讼法》的相关规定，运输合同纠纷可由运输始发地、目的地或被告住所地的人民法院管辖。这意味着，如果纠纷发生在异地，您有权选择在上述任一地点的人民法院提起诉讼。同时，如果合同中有明确的管辖法院约定，且该约定合法有效，那么您应按照约定向该法院提起诉讼。
二、准备起诉材料
在确定管辖法院后，您需要准备起诉材料。这些材料包括但不限于：
起诉状：详细列明原被告信息、诉讼请求、事实与理由。在事实与理由部分，您需要清晰陈述纠纷的经过，包括合同签订、履行情况、纠纷产生的原因等，并说明您提出诉讼请求的法律依据。
证据材料：收集并整理与纠纷相关的证据，如合同文本、运输单据、货物交付凭证、沟通记录、损失证明等。这些证据应能够证明您的诉讼请求的合理性和合法性。
三、提交起诉并缴费
准备好起诉材料后，您需要前往选定的法院立案庭提交起诉状及证据材料，并缴纳案件受理费。如果您选择线上提交，可以通过法院的官方网站或移动应用完成网上立案流程。在提交时，请确保所有材料真实有效，并按照法院的要求准备足够的副本。
四、参与庭审过程
提交起诉后，您需要等待法院的审理通知。在庭审过程中，您应积极参与，包括法庭调查、辩论、最后陈述等环节。在庭审前，建议您熟悉案件事实，整理辩论思路，以便在庭审中能够清晰、准确地阐述自己的观点。
五、等待判决与执行
庭审结束后，法院会根据审理情况作出判决。如果您对判决结果不服，可以在上诉期内提起上诉。如果对方未履行判决义务，您可以在规定期限内向法院申请强制执行，通过法律手段迫使对方履行判决。
六、特别建议
咨询专业律师：由于异地起诉可能涉及复杂的法律程序和司法实践，建议您咨询并聘请熟悉当地法律和司法实践的律师，以获得专业指导和支持。
注意诉讼时效：请确保您的起诉不超过诉讼时效期限，以免丧失法律权利。
保持冷静理性：在整个诉讼过程中，请保持冷静、理性，以事实为依据，以法律为准绳，维护自身合法权益。
综上所述，面对运输合同纠纷案件被异地起诉的情况，您应首先确定管辖法院，然后准备起诉材料并提交起诉，积极参与庭审过程，最后等待判决并执行。同时，建议您咨询专业律师以获得更全面的法律支持。