未经另一版权共有人同意，单独一个公司不可以擅自授权版权。具体分析如下：

一. 版权共有的含义

• 版权属于两个公司时，即形成版权共有。在版权共有关系中，各共有人对版权享有平等的权利，包括使用权、收益权等。

二. 版权共有的行使

• 根据《中华人民共和国著作权法实施条例》第九条：“合作作品不可以分割使用的，其著作权由各合作作者共同享有，通过协商一致行使；不能协商一致，又无正当理由的，任何一方不得阻止他方行使除转让、许可他人专有使用、出质以外的其他权利，但是所得收益应当合理分配给所有合作作者”。
• 版权共有时，对于版权的使用、处分等行为，通常需要经过共有人的协商一致。如果未经其他共有人同意，单独一个公司擅自授权版权，可能会侵犯其他共有人的合法权益。

三. 单独授权的法律后果

• 如果一个公司未经另一公司同意单独授权版权，可能会导致授权行为无效，甚至引发法律纠纷。被侵权的公司有权要求停止侵权行为，并赔偿因此造成的损失。

• 例如，A公司和B公司共同拥有一项软件的版权。如果A公司未经B公司同意，擅自将软件授权给第三方使用，那么B公司有权要求A公司停止这种侵权行为，并可能要求A公司赔偿因此给B公司造成的损失。

综上所述，在版权属于两个公司的情况下，单独一个公司不可以擅自授权版权，而应当与其他共有人协商一致后共同行使版权。如有进一步需要，您可以继续咨询我。