在车祸导致人员在医院死亡且责任不明确的情况下，后事处理需要遵循一定的流程，以确保事情的妥善处理。以下是一个详细的后事处理流程：

一、确认死亡与获取证明

1. 确认死亡：首先，需要由医疗机构出具的有效死亡证明书，这是后续处理一系列手续的关键凭证。
2. 获取证明：务必在第一时间索取死亡证明书，并妥善保管。

二、通知与报案

1. 通知家属：及时通知死者的直系亲属，并告知他们相关情况。
2. 报案处理：向警方报案，说明事故情况，协同警方开展详尽的事故调查及责任判定工作。

三、遗体处理与丧葬安排

1. 遗体处理：联系正规的殡仪服务机构，将遗体转运至太平间或殡仪馆，并安排遗体火化事宜。
2. 丧葬安排：根据当地丧葬习俗，选择墓地、确定葬礼形式，并通知亲朋好友参加葬礼。

四、事故调查与责任认定

1. 配合调查：积极配合警方的事故调查工作，提供必要的证据和信息。
2. 责任认定：等待警方出具事故责任认定书，以明确事故责任。若对责任认定有异议，可依法提出复议或诉讼。

五、赔偿协商与法律途径

1. 赔偿协商：在责任明确后，积极与肇事方展开相关赔偿事项的磋商，包括医疗费、丧葬费、死亡赔偿金等。
2. 法律途径：若协商无果，可运用法律手段加以解决，如向法院提起诉讼，要求肇事方承担相应的赔偿责任。

六、办理相关证件注销

1. 户口注销：前往户籍所在地派出所办理户口注销手续。
2. 其他注销：到死者工作单位办理社保等相关账户的注销手续。

七、其他注意事项

1. 财产梳理：对遇难者的相关财产及负债状况进行全面梳理，以便后续处理。
2. 保持冷静：在整个后事处理过程中，家属需要保持冷静，依法依规妥善安排各项事宜。

总之，在车祸导致人员在医院死亡且责任不明确的情况下，后事处理需要遵循一定的流程，并积极配合警方的事故调查工作。同时，也要注重与肇事方的赔偿协商，并依法维护自身权益。