关于“施工合同中约定发包人指示确定的时间是否算工期”的问题，我们可以从以下几个方面进行详细分析：
首先，明确结论：施工合同中约定发包人指示确定的时间，在通常情况下是会被计入工期的，但这也取决于合同的具体条款以及实际施工情况。
接下来，我们分情况讨论：
合同有明确约定：
- 如果施工合同中明确规定了发包人指示确定的时间计入工期，那么无疑，这段时间是应该被计入工期的。这是基于合同双方自愿、平等、协商一致的原则，也是合同法律效力的体现。
合同没有明确约定，但符合行业惯例：
- 在某些情况下，即使施工合同中没有明确约定发包人指示确定的时间是否计入工期，但如果这一做法符合建设工程行业的惯例或通常做法，那么也有可能会被认定为应计入工期。这需要根据具体的行业情况和惯例来判断。
合同没有明确约定，也不符合行业惯例：
- 如果施工合同中没有明确约定，且这一做法也不符合行业惯例，那么就需要根据合同的其他条款、实际施工情况以及双方当事人的真实意思表示来综合判断。在这种情况下，可能会存在争议，需要通过协商、调解或诉讼等方式来解决。
此外，还需要考虑以下因素：
- 发包人指示的合理性：发包人的指示应当是合理且必要的，如果指示不合理或不必要的，承包人有权拒绝执行，并且这段时间也不应计入工期。
- 承包人的响应速度：承包人在收到发包人的指示后，应当及时、有效地进行响应和执行。如果承包人拖延执行或执行不力，那么这段时间也不应完全计入工期。
综上所述，施工合同中约定发包人指示确定的时间是否算工期，需要根据合同的具体条款、实际施工情况以及行业惯例来综合判断。如果合同有明确约定或符合行业惯例，那么这段时间是应该被计入工期的。如果合同没有明确约定且不符合行业惯例，则需要根据具体情况来综合判断。如有任何疑问或争议，建议及时咨询专业律师以获取更准确的法律意见。