没有林权证仅凭第三方以房屋抵押担保发放承包林木林地巨额贷款，这一行为在合法性上存在问题。以下是对该问题的详细分析：

1. 林权证的必要性：

   • 林权证是林木和林地的合法权属证明，是权利人享有林木林地使用权、收益权和处分权的重要法律依据。
   • 在没有林权证的情况下，无法确认林木林地的权属，因此无法进行合法的抵押担保。

2. 抵押担保的合法性：

   • 抵押担保是指债务人或第三人不转移对某一特定物的占有，而将该特定物作为债权的担保，在债务人不履行债务时，债权人有权依照法律规定以该特定物折价或者以拍卖、变卖该特定物的价款优先受偿。
   • 在没有林权证的情况下，以房屋作为抵押物来担保林木林地的贷款，可能存在抵押物与担保债权不匹配的问题，即抵押物（房屋）与所担保的债权（林木林地贷款）之间缺乏直接的法律联系。

3. 贷款发放的合规性：

   • 银行或金融机构在发放贷款时，通常会要求借款人提供足额的抵押物或担保，并确保抵押物或担保的合法性、有效性和足值性。
   • 在没有林权证的情况下，银行或金融机构仅凭房屋抵押就发放巨额的林木林地贷款，可能违反了贷款发放的合规性要求。

4. 法律后果：

   • 如果该贷款行为被认定为非法或无效，那么借款人可能面临无法获得贷款或需要返还已获得的贷款的风险。
   • 同时，银行或金融机构也可能因为违规发放贷款而面临监管处罚或法律诉讼的风险。

综上所述，没有林权证仅凭第三方以房屋抵押担保发放承包林木林地巨额贷款，在合法性上存在问题。建议借款人在申请贷款时，应提供合法的权属证明和足额的抵押物或担保；银行或金融机构在发放贷款时，也应严格审查借款人的资信状况和抵押物或担保的合法性、有效性和足值性。如有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。