调解书上让欠款人分期三年还完是合法的。具体分析如下：

一. 调解书的法律效力

1. 调解书是人民法院根据当事人自愿原则，在事实清楚的基础上，分清是非，进行调解后制作的法律文书。它一经双方当事人签收，即具有法律效力，当事人必须履行。
2. 调解书的内容，包括调解协议的内容，是当事人自愿达成的，是当事人真实的意思表示，对当事人具有法律约束力。

二. 强制执行期限与调解书约定的还款期限

1. 强制执行期限是法律规定的，债权人可以在该期限内申请法院强制执行债务人的财产以清偿债务。这一期限通常是为了保护债权人的权益，确保债务不会无限期地拖延。
2. 调解书约定的还款期限是当事人之间自愿达成的协议，它并不受强制执行期限的限制。只要调解书的内容合法，且当事人自愿接受，那么约定的还款期限就是有效的。
3. 因此，即使强制执行期限为两年，调解书上约定的三年分期还款期限也是合法的。这是因为调解书的约定是当事人之间的自愿行为，且并不违反法律的强制性规定。

三. 实际履行与法律后果

1. 如果欠款人按照调解书的约定分期还款，那么就不会产生强制执行的问题。
2. 如果欠款人未按照调解书的约定履行还款义务，债权人可以在强制执行期限内申请法院强制执行。此时，法院会根据调解书的内容以及欠款人的实际情况，采取相应的执行措施。

综上所述，调解书上让欠款人分期三年还完是合法的，这是当事人之间的自愿约定，且并不违反法律的强制性规定。如有进一步需要，您可以继续咨询我。