案件的基本事实不在事实认定中，而在本院认为部分认定是违法的。具体分析如下：

1. 判决书结构：

   • 判决书通常包含两大基础部分：一是事实认定部分，二是本院认为部分。
   • 事实认定部分是对庭审事实或查明的事实的客观陈述。
   • 本院认为部分则是法院的主观分析、主观认为或主观想象。

2. 违法性分析：

   • 将案件的基本事实放在本院认为部分进行认定，违反了判决书的主客观相统一原则。
   • 客观事实是基础，主观分析是判项的桥梁。将客观事实放入主观分析中，等于用主观来分析主观，犯了唯心主义的错误。
   • 这种做法也不符合以事实为基础、以法律为准绳的司法原则。

3. 法律依据：

   • 根据《最高人民法院关于民事诉讼证据的若干规定》第六十三条，人民法院应当以证据能够证明的案件事实为依据依法作出裁判。
   • 如果本院认为部分的事实认定未写在事实认定中，那么该事实认定就不能作为裁判的依据。

4. 实际影响：

   • 这种做法可能导致判决缺乏事实依据，进而影响判决的公正性和权威性。
   • 如果本院认为部分夹带了“私货”（即未在事实认定中出现的事实），那么判决就可能构成错案。

5. 最高院判例：

   • 最高人民法院在【(2016)最高法民申2788号】判例中明确指出，原审判决未在“经审理查明”部分对案件争议事实予以认定，而仅在“本院认为”部分对有关事实予以认定，属于“原判决、裁定认定的基本事实缺乏证据证明的”情形，应予再审。

综上所述，案件的基本事实不在事实认定中，而在本院认为部分进行认定是违法的。这种做法违反了判决书的主客观相统一原则，不符合司法原则，且可能导致判决缺乏事实依据和公正性。因此，在撰写判决书时，应严格区分事实认定部分和本院认为部分，确保判决的合法性和公正性。