公司因营业执照丢失而处罚员工是违法的。下面我从法律角度为您详细解析：

1. 公司无权随意处罚员工：

   • 公司对员工进行处罚，必须有明确的法律依据或公司规章制度作为支撑，并且这些规章制度必须是合法、合理且经过正当程序制定的。
   • 营业执照的丢失通常属于公司管理层面的问题，与员工个人行为无直接关联。因此，公司不能仅凭此就对员工进行处罚。

2. 营业执照丢失的法律责任：

   • 营业执照是公司合法经营的凭证，其丢失应及时向工商行政管理部门报告，并按照规定办理补领手续。
   • 如果因营业执照丢失导致公司面临法律风险或经济损失，公司应通过合法途径追究相关责任人的责任，而不是简单地对员工进行处罚。

3. 员工权益保护：

   • 员工在公司工作，享有合法的劳动权益。公司无故处罚员工，可能侵犯员工的合法权益。
   • 如果员工认为公司处罚不当，可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。

综上所述，公司因营业执照丢失而处罚员工是违法的。公司应依法管理，合理制定规章制度，并严格遵守法律法规，保障员工的合法权益。如果员工遇到此类问题，可以及时向我咨询，我会为你提供专业的法律帮助。