夫妻双方三岁以下婴幼儿照护的专项附加扣除，并不是只能由一方填写。根据我国个人所得税法及其实施细则，以及国务院印发的相关通知，关于三岁以下婴幼儿照护的专项附加扣除，夫妻双方都可以进行申报。

一. 夫妻双方均可申报

• 夫妻双方都可以根据实际情况，选择由其中一方扣除婴幼儿照护费用，或者双方协商分配扣除比例。

二. 扣除方式与比例

• 夫妻双方可以选择由其中一方按扣除标准的100%扣除，即一人每月2000元的标准定额扣除。
• 也可以选择由双方分别按扣除标准的50%扣除，即每人每月1000元的标准定额扣除。

三. 扣除年度与限制

• 扣除时间为婴幼儿出生的当月至年满3周岁的前一个月。
• 同一子女的婴幼儿照护费用，不能由夫妻双方同时按100%的比例扣除，具体扣除方式在一个纳税年度内不能变更。

四. 申报流程

• 纳税人需要登录个人所得税APP，按照指引填写相关信息，包括子女身份信息、配偶信息、扣除比例等。
• 选择申报方式，可以是“通过扣缴义务人申报”或“年度自行申报”。

五. 注意事项

• 纳税人需要确保所提交的材料真实、完整，避免因材料问题导致的税务风险。

• 及时关注税法政策的变化，以便及时调整申报策略。

• 例如，如果夫妻双方都有收入，且都符合扣除条件，他们可以协商决定是由一方全额扣除，还是双方各扣除一半。这样的设计旨在更灵活地适应不同家庭的实际情况，确保税收政策的公平性和合理性。

综上所述，夫妻双方都可以申报三岁以下婴幼儿的照护费用扣除，具体扣除方式需根据双方协商确定，并遵守相关税法规定。如有进一步需要，您可以继续咨询我。