关于合同上两个章大小不一样的问题，其核心在于这样的差异是否会影响合同的效力。以下是对此问题的详细分析：

1. 合同效力与章的大小无直接关系：

   • 合同的效力主要取决于是否为当事人真实意思的表示，以及是否违反法律法规的强制性规定。
   • 章的大小不同，并不直接决定合同的效力。关键在于盖章行为是否真实、合法，以及盖章主体是否有签约权限。

2. 盖章行为真实合法，合同通常有效：

   • 如果盖章所代表的当事人认可这份合同，即使章的大小存在差异，只要能证明该印章是合法有效的，合同一般就是有效的。
   • 例如，如果公司之前曾用同样大小的章签订过其他合同，或者能证明此章是公司授意使用的，这种情况下合同应被认定为有效。

3. 盖章存疑，合同效力可能受影响：

   • 如果一方以章大小不同为由，主张该印章并非自己的真实印章，并且经过鉴定或有其他证据表明盖章并非当事人的真实意愿，或者印章是伪造的，那么合同的效力可能会受到影响。
   • 在这种情况下，合同可能因为缺乏真实意思表示而无效或者可撤销。

4. 主张合同瑕疵需证据支持：

   • 如果一方以章大小不同为由声称合同有瑕疵或者无效，就需要拿出进一步的证据来证明盖章行为存在问题，如存在欺诈、胁迫等情况，或者盖章主体超越了权限。
   • 如果不能提供充足的证据，仅仅凭借章大小不同就质疑合同效力，通常很难得到支持。

综上所述，合同上两个章大小不一样，并不直接决定合同的效力。关键在于盖章行为的真实性与合法性，以及盖章主体是否有签约权限。如果您在合同签订或履行过程中遇到类似问题，建议保留好相关证据，并咨询专业律师以获取更具体的法律建议。