公司被恶意举报没有营业执照时，可以考虑采取法律手段维护自身权益，包括但不限于反起诉举报人。以下是对此问题的详细分析：

1. 判断举报性质：

   • 首先，需要明确举报是否出于恶意。若举报人明知公司持有合法营业执照，仍出于竞争、报复等目的进行举报，则构成恶意举报。

2. 应对措施：

   • 向工商部门说明情况：当工商局前来检查时，应及时、如实出示营业执照及相关证明文件，以证实公司的合法经营状态。同时，可向工商部门反映这是恶意举报，并提交能证明举报内容与事实不符的证据。
   • 收集证据：若恶意举报导致公司遭受实际损失，应收集相关证据，包括财务记录、客户反馈等，以证明损失的存在和程度。这些证据将在后续可能提起的诉讼中发挥关键作用。
   • 法律途径追究责任：若认为恶意举报造成了严重损失或影响了商誉，公司有权向法院提起民事诉讼，要求举报人承担停止侵害、消除影响、恢复名誉、赔偿损失等民事责任。

3. 反起诉的考虑：

   • 在确定举报人存在恶意，且公司的合法权益确实受到侵害的情况下，公司可以考虑反起诉举报人。反起诉的法律依据主要基于《中华人民共和国民法典》中关于侵权责任的相关规定。
   • 反起诉时，需要准备充分的证据来证明举报人的恶意以及公司因此遭受的损失。同时，也需要考虑诉讼的成本和可能带来的法律后果。

4. 保持冷静与理智：

   • 面对恶意举报，保持冷静和理智至关重要。切勿采取过激行为或回应，而应通过合法途径解决问题。

综上所述，公司被恶意举报没有营业执照时，可以采取一系列措施来维护自身权益。在必要时，可以考虑反起诉举报人来维护公司的合法权益。若在此过程中有任何法律问题或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。