针对您提出的“公司已合法注销，清算时未主张保证金怎么办”的问题，这里是我的详细解答：
结论前置：
公司注销后，如果清算时未主张保证金，一般情况下，这笔保证金可能被视为公司资产的遗漏部分。由于公司已经合法注销，其法人资格已经终止，因此无法再以公司的名义去主张这笔保证金。但可以尝试通过以下途径来解决问题：
查明保证金归属：
- 首先，需要查明这笔保证金的归属情况，即保证金是存放在哪个机构或账户中，以及是否有明确的归属协议或合同条款。
- 如果保证金有明确的归属协议或合同条款，且该协议或条款在公司注销后仍然有效，那么可以尝试依据这些文件来主张保证金。
联系相关机构或个人：
- 如果保证金是存放在银行或其他金融机构中，可以联系这些机构，了解保证金的提取流程和所需材料。
- 如果保证金与特定的交易或合同相关，可以联系交易对方或合同相对方，协商保证金的处理方式。
寻求法律途径：
- 如果无法通过协商或联系相关机构解决问题，可以考虑寻求法律途径。例如，如果保证金被他人非法侵占，可以向法院提起诉讼，要求返还保证金。
- 需要注意的是，由于公司已经注销，其法人资格已经终止，因此无法再以公司的名义提起诉讼。此时，可以尝试以公司股东、债权人或其他相关利益人的名义提起诉讼。
考虑税务和会计处理：
- 如果保证金最终得以返还或处理，还需要考虑税务和会计处理的问题。例如，保证金是否需要缴纳税款，以及如何在会计账簿上进行记录等。
补充建议：
- 在处理此类问题时，建议咨询专业的律师或会计师，以确保您的权益得到充分保障。
- 如果公司注销前未对保证金进行妥善处理，可能会给公司股东、债权人等带来不必要的麻烦和损失。因此，在公司注销前，建议对公司的资产和负债进行全面清查和处理。
希望以上解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。