关于公司注销时账务往来款代收付款是否合法的问题，我们可以从以下几个角度进行分析：

1. 公司注销的法定程序：

   • 公司注销需要按照《公司法》及相关法律法规的规定进行，包括清算、公告、注销登记等步骤。
   • 在注销过程中，公司需要处理完毕所有的债权债务关系，确保无遗留问题。

2. 账务往来款的处理：

   • 账务往来款是公司与其他主体之间的经济交易记录，包括应收款、应付款等。
   • 在公司注销前，这些账务往来款应当得到妥善处理，如通过清偿、转让、协商等方式解决。

3. 代收付款的合法性：

   • 代收付款通常指公司代为收取或支付款项的行为。
   • 在公司正常运营期间，如果代收付款行为有明确的法律依据或合同约定，且符合相关法律法规的规定，则是合法的。
   • 但在公司注销过程中，由于公司的法律主体地位即将灭失，其代收付款行为可能受到更多限制。

4. 注销期间的特殊考虑：

   • 在公司注销期间，由于公司即将丧失法人资格，其进行任何经济交易或代收付款行为都需要特别谨慎。
   • 如果注销期间公司仍然进行代收付款行为，且没有明确的法律依据或合同约定，或者违反了相关法律法规的规定，则可能构成违法行为。

综上所述，公司注销时账务往来款代收付款的合法性取决于具体情况。如果公司在注销前已经妥善处理了所有的债权债务关系，且代收付款行为有明确的法律依据或合同约定，并符合相关法律法规的规定，则是合法的。但如果公司在注销期间仍然进行代收付款行为，且没有充分的法律依据或合同约定支持，或者违反了相关法律法规的规定，则可能构成违法行为。

因此，建议公司在注销前务必妥善处理所有的账务往来款和债权债务关系，并咨询专业律师以确保注销过程的合法性和合规性。如果您在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。