针对您提出的“有合同协议但欠款未能追回，应该如何处理”的问题，以下是我为您提供的详细解答：

首先，您需要确认手中合同的合法性和有效性。这包括检查合同内容是否明确、双方是否都已签字盖章，以及合同是否符合相关法律法规的规定。只有确保合同的合法性，才能为后续的法律行动提供坚实的基础。

在确认合同有效后，如果欠款人未按照合同约定的还款时间和方式进行还款，您可以首先尝试通过友好协商的方式催促欠款人还款。在协商过程中，建议您保留好所有相关的证据，如聊天记录、通话录音、邮件往来等，以备后续使用。

如果协商无果，您可以选择向法院提起诉讼来维护自己的合法权益。在起诉前，您需要准备好所有相关的证据材料，包括合同、转账记录、协商过程的证据等，并明确您的诉讼请求，即要求欠款人归还欠款及可能产生的利息等。

在诉讼过程中，您需要遵循法院的程序规定，积极参与庭审，并根据法院的要求提供必要的证据和陈述。法院会根据双方提供的证据进行审理，并依法作出判决。如果判决支持您的诉讼请求，欠款人将被要求归还欠款。

此外，您还可以在起诉前或诉讼过程中申请财产保全，以冻结欠款人的财产，确保在判决后能够顺利执行。财产保全是一种有效的法律手段，可以帮助您保障自己的权益。

需要注意的是，诉讼时效是一个重要的法律概念。在大多数情况下，债权权利的诉讼时效为三年，从约定的还款期限届满之日起计算。如果超过诉讼时效，您的权利可能无法得到法律的完全保护。因此，建议您在发现欠款问题后尽快采取行动，以避免超过诉讼时效。

总之，有合同协议的情况下，通过合法途径是可以追回欠款的。但需要您积极采取行动，保留好相关证据，并遵循法律程序。希望以上解答能够对您有所帮助。