当绩效工资高于合同总工资时，这通常表明您的实际收入超出了最初与雇主约定的水平，这一般不是一个大问题，而且往往对劳动者是有利的。不过，为了确保您的权益得到妥善保护，并避免未来可能出现的任何潜在争议，您可以采取以下步骤：

一、确认工资发放记录

首先，确保您有充分的证据来证明您的实际工资水平，这包括但不限于银行流水、工资条、电子转账记录等。这些记录是证明您实际收入高于合同约定工资的关键证据。

二、与雇主沟通

1. 明确工资标准：与雇主沟通，确认这种高于合同约定的工资发放是否是长期性的，还是仅仅是一次性或临时性的调整。
2. 协商补充协议：为了防止未来可能出现的争议，建议与雇主协商签订一份工资调整的补充协议。这份协议应明确新的工资标准、发放方式以及任何与工资相关的其他条款。

三、关注潜在问题

1. 社保缴纳：部分地区社保缴纳基数与工资挂钩，如果工资提高了但社保基数没有相应调整，可能违反社保法规，导致未来需要补缴和罚款。因此，请确保您的社保缴纳与您的实际工资水平相符。
2. 税务问题：超出合同约定的绩效工资部分也需要依法纳税。请确保您了解并遵守相关的税务规定，避免因税务问题产生风险。
3. 经济补偿和加班费计算：在计算经济补偿、加班费等时，如果发生劳动纠纷，用人单位可能按合同约定工资计算，而您可能主张按实际工资计算。为避免这种情况，最好在补充协议中明确这些计算标准。

四、保留证据和寻求法律帮助

1. 保留所有相关证据：包括工资发放记录、与雇主的沟通记录、签订的任何补充协议等。这些证据在未来可能出现的争议中将是至关重要的。
2. 寻求法律帮助：如果您对任何与工资相关的问题感到困惑或担忧，或者认为您的权益受到了侵犯，请寻求专业的法律帮助。

总之，当绩效工资高于合同总工资时，虽然这通常是一件好事，但也需要您采取一些措施来确保您的权益得到妥善保护。通过与雇主沟通、签订补充协议、关注潜在问题以及保留证据和寻求法律帮助，您可以更好地管理这种情况并避免未来可能出现的任何争议。