关于水利工程鉴定书运行管理单位是否需要盖章的问题，我们可以从相关的规程出发来详细解答。

首先，根据《水利水电建设工程验收规程》SL223—2008的规定，进行水利工程分部工程及单位工程验收时，涉及到的文件包括分部工程验收评定表、单位工程验收评定表以及相对应的工程鉴定书。这些文件在验收过程中具有重要的法律效应和证明作用。

针对您提到的盖章问题，规程中明确指出，在这些文件的加盖单位印章处，是可以使用项目章的。这意味着，在水利工程鉴定书的扉页或其他需要加盖印章的位置，运行管理单位可以选择使用项目章来代替单位公章，以满足验收的法定要求。

综上所述，水利工程鉴定书运行管理单位在需要盖章时，可以使用项目章进行加盖，这是符合《水利水电建设工程验收规程》SL223—2008的规定的。如果您在实际操作中遇到任何具体问题或需要进一步的解释，建议咨询相关的水利部门或专业机构，以确保操作的准确性和合规性。