当然可以起诉。分公司不存在了，总公司账户也被冻结，并不影响公司作为诉讼主体的资格，也不影响其行使起诉的权利。下面我为你详细解释一下：

1. 公司诉讼主体资格：

   • 分公司作为总公司的分支机构，其民事责任由总公司承担。即使分公司不存在了，总公司依然可以作为诉讼主体参与诉讼。
   • 总公司账户被冻结，只是公司财产状态的一种变化，并不影响公司的法人资格和诉讼权利。

2. 起诉的可行性：

   • 只要存在合法的诉讼请求和事实依据，公司就可以向法院提起诉讼。
   • 账户被冻结可能会影响公司的资金流动，但并不影响公司行使起诉这一法律权利。

3. 实际操作建议：

   • 在起诉前，建议公司先梳理好案件事实和证据，确保诉讼请求的合理性和合法性。
   • 考虑到账户被冻结的情况，公司可能需要通过其他方式筹集资金来支付诉讼费用和律师费用。
   • 如果公司担心账户被冻结会影响诉讼的顺利进行，可以向法院申请财产保全措施，以确保诉讼过程中公司的合法权益得到保障。

综上所述，即使分公司不存在了，总公司账户也被冻结，公司依然可以行使起诉的权利。如果你在这方面有具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。