门店协议转让后，如果营业执照没有及时更换，不再经营并直接离开，可能会产生一系列的法律后果和影响。以下是对这一问题的详细分析：
对转让方的影响
民事责任风险：
- 尽管门店已经通过协议转让，但如果营业执照上的经营者信息仍然是转让方的名字，那么在受让方经营期间产生的任何债务纠纷（如拖欠货款、员工工资、消费者投诉等），债权人或受害者可能会依据营业执照上的信息向转让方追讨。转让方虽然可以依据转让协议进行抗辩，但这种抗辩往往不能对抗善意第三人，从而可能被卷入不必要的诉讼中。
行政责任风险：
- 根据《中华人民共和国市场主体登记管理条例》等相关法律法规，市场主体变更登记事项（包括经营者变更）后，未在规定时间内办理变更登记的，登记机关可以责令改正并处以罚款。因此，转让方可能会面临行政处罚。
- 此外，出租、出借、转让营业执照属于违法行为，转让方还可能因此受到更严厉的行政处罚。
对受让方的影响
经营受限：
- 营业执照未变更，受让方无法以自己的名义开展业务，包括签订合同、开具发票等，这将严重影响业务的正常开展。
- 在某些需要行政许可或审批的行业，营业执照未变更可能导致受让方无法申请相关许可或审批，从而限制业务的拓展。
权益难以保障：
- 由于经营权仍然归原登记的经营者（即转让方），受让方的合法权益可能无法得到充分保障。特别是在遇到拆迁、征收等情况时，受让方可能无法获得相应的补偿。
- 双方权利义务关系不清晰，一旦发生纠纷，解决难度将大大增加。
税务及其他问题：
- 受让方如果未进行税务申报等法定事项，可能会面临税务处罚。
- 营业执照是办理其他证件（如食品经营许可证、烟草专卖零售许可证等）的基础，一旦营业执照失效，这些证件也需要重新申请，增加了麻烦和成本。
对消费者和第三方的影响
- 消费者可能因营业执照信息未更新而对店铺经营者产生误解，从而影响店铺的声誉和消费者的信任度。
- 第三方在交易过程中可能难以准确了解店铺的实际经营情况和经营者身份，从而增加交易风险。
应对措施与建议
- 及时办理变更手续：门店转让后，应立即向登记机关申请办理营业执照的变更手续，确保信息与实际经营者一致。
- 法律咨询与审查：在转让前咨询专业律师（如我），审查转让合同，明确双方权利义务，降低法律风险。
- 关注税务与其他证件：转让后及时更新税务信息和其他相关证件，确保合规经营。
综上所述，门店协议转让后未及时更换营业执照并直接离开，可能会给转让方、受让方、消费者及第三方带来严重的法律后果和经营风险。因此，务必在店铺转让时及时办理相关变更手续，以确保合法经营并避免不必要的法律风险。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。