可以在交通事故中不主张医疗费，而在工伤赔偿中主张医疗费，但一般不能重复主张。下面我为您详细解释：

从法理角度来看，医疗费是以填平损失为原则的。工伤保险赔付的医疗费是基于劳动关系，旨在补偿职工因工伤治疗所支出的费用；而交通事故侵权人赔偿的医疗费则是基于侵权责任，用于填补受害人因交通事故所产生的医疗费用损失。如果两者都进行赔偿，那么受害人可能会获得超出其实际医疗费用支出的利益，这在法律上通常是不被允许的。

然而，在实际操作中，可能会存在一些细微的差异。例如，如果工伤保险基金先行支付了医疗费，那么它有权向交通事故的第三方进行追偿。这种情况下，医疗费的最终赔付情况可能会受到影响。

另外，需要注意的是，交通事故工伤的认定和责任划分也是影响医疗费赔付的重要因素。一般来说，职工在上下班途中受到非本人主要责任的交通事故伤害，才有可能被认定为工伤。因此，在处理交通事故和工伤赔偿的问题时，需要综合考虑多个方面的因素。

综上所述，虽然理论上您可以选择在交通事故中不主张医疗费而在工伤赔偿中主张，但实际操作中需要考虑到医疗费不能重复主张的原则以及具体的责任认定和赔付情况。如果您在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。