退休干部已在农村建房是否违法，需根据其户口情况、宅基地资格权以及是否遵循审批程序来判断。

一. 户口与宅基地资格权的影响

1. 若户口仍在农村且为集体经济组织成员：

   • 退休干部若户口未迁出，仍属于农村集体经济组织成员，则具备申请宅基地的资格权。在此情况下，若其建房行为符合当地宅基地申请条件，并经过了合法审批，则建房是合法的。

2. 若户口已迁出农村：

   • 若退休干部的户口已迁出农村，则不再具备申请新宅基地的资格。若其在农村建房，且未经过合法审批或不属于原有宅基地上的合法建设，则此行为可能构成违法。

二. 宅基地的相关规定与审批程序

• 根据《中华人民共和国土地管理法》和《中华人民共和国民法典》，宅基地使用权人需依法对集体所有的土地进行占有和使用，且宅基地使用权的取得、行使和转让必须遵守土地管理法律和国家有关规定。
• 农村村民建住宅应符合乡（镇）土地利用总体规划和村庄规划，并需办理相关审批手续。若未按规定申请审批，私自开工建设，则属于未批先建的违法行为。

三. 违法行为的界定

• 若退休干部非农村集体经济组织成员，却通过不正当手段获取宅基地进行建房，或即使具备资格但未按规定申请审批，私自开工，这些行为均可能被视为违法。
• 违法建筑可能面临拆除等处理，并需承担相应的法律责任。

综上所述，退休干部已在农村建房是否违法，需具体分析其户口情况、宅基地资格权以及是否遵循了审批程序。若存在违法行为，则应依法承担相应责任。如有进一步需要，您可以继续咨询我。