关于“机关保密主体责任由谁承担”这一问题，我可以明确地告诉你，各单位各部门在保密工作中承担着不可替代的主体责任。下面我将从几个方面详细阐述这一结论：

1. 主体责任明确：

   • 各单位各部门作为本单位本部门保密工作的责任主体，其主要负责人是保密工作的第一责任人，需对保密工作全面负责。这包括组织贯彻落实党和国家保密工作方针政策、法律法规，将保密工作纳入重要议事日程，并研究解决重大问题。
   • 领导班子其他成员对分管工作范围内的保密工作负重要领导责任，需将保密要求融入业务工作，加强分管部门、人员的保密教育、管理和监督。
   • 全体人员都应严格遵守保密规章制度，履行保密义务，共同维护秘密信息的安全。

2. 保密工作责任制的实施：

   • 根据《中华人民共和国保守国家秘密法》的相关规定，机关、单位应当实行保密工作责任制，健全保密管理制度，完善保密防护措施，开展保密宣传教育，加强保密检查。
   • 这意味着各单位各部门需要建立健全保密管理制度，明确保密工作的具体要求、流程和责任分工，确保保密工作的有效开展。

3. 保密措施的具体落实：

   • 各单位各部门需按照保密管理制度的要求，采取加密通信、文件保管、涉密人员管理、网络安全防护等有效措施，确保秘密信息不被泄露或非法获取。
   • 同时，还需定期对本单位、本部门的保密工作进行自查和互查，及时发现并纠正存在的问题，接受上级部门或相关机构的保密检查和监督。

4. 责任追究的严肃性：

   • 对于违反保密规定的行为，各单位各部门应依法依规进行严肃处理，追究相关人员的责任。这既是对违规行为的惩戒，也是对全体员工的一种警示和教育。
   • 严格的责任追究制度能够确保保密工作的严肃性和权威性，促使全体员工更加自觉地遵守保密规定。

综上所述，机关保密主体责任由各单位各部门承担，这是由法律法规明确规定的。各单位各部门应切实履行保密工作主体责任，建立健全保密管理制度，加强保密宣传教育，切实落实保密措施，开展保密检查与监督，并严格责任追究，以确保秘密信息的安全和保密工作的有效开展。如果你在这方面有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请随时向我提问。