根据最新的《中华人民共和国食品安全法》，对患有国务院卫生行政部门规定的有碍食品安全疾病的人员从事接触直接入口食品的工作的处罚是：由县级以上人民政府食品药品监督管理部门责令改正，给予警告；拒不改正的，处五千元以上五万元以下罚款；情节严重的，责令停产停业，直至吊销许可证。以下是具体的法律依据和分析：

一. 法律依据

• 《中华人民共和国食品安全法》第一百二十六条：违反本法规定，有下列情形之一的，由县级以上人民政府食品药品监督管理部门责令改正，给予警告；拒不改正的，处五千元以上五万元以下罚款；情节严重的，责令停产停业，直至吊销许可证：……（六）食品生产经营者安排未取得健康证明或者患有国务院卫生行政部门规定的有碍食品安全疾病的人员从事接触直接入口食品的工作。

二. 分析

1. 适用情形：该条款适用于食品生产经营者安排未取得健康证明或患有有碍食品安全疾病的人员从事接触直接入口食品的工作的情形。
2. 处罚措施：
   • 首次发现，由县级以上人民政府食品药品监督管理部门责令改正，并给予警告。
   • 拒不改正的，将处以五千元以上五万元以下罚款。
   • 情节严重的，将责令停产停业，甚至吊销许可证。

三. 总结

食品生产经营者必须严格遵守食品安全法规，不得安排患有有碍食品安全疾病的人员从事接触直接入口食品的工作。否则，将面临严厉的行政处罚。我建议食品生产经营者加强员工健康管理，确保员工符合食品安全要求，以避免不必要的法律风险。如有进一步需要，您可以继续咨询我。