对于不同的公司做的同一业主单位的不同类业务，如这两家公司有违法行为，将依据各自违法行为的性质、情节和法律规定独立进行处罚。具体分析如下：

一. 独立处罚原则

1. 各自独立承担责任：根据《中华人民共和国行政处罚法》等相关法律规定，不同的公司作为独立的法人实体，各自对其违法行为承担法律责任。即使它们服务于同一业主单位，且业务类型不同，也不会因此影响各自违法行为的独立性和应受处罚的性质。
2. 不连带处罚：一家公司的违法行为不会导致另一家公司受到连带处罚，除非有证据证明两家公司存在共同违法、串通违法或协助违法等情形。

二. 处罚依据和程序

1. 依据各自违法行为：行政处罚机关将依据每家公司的具体违法行为，如虚假宣传、不正当竞争、侵犯知识产权等，以及违法行为的性质、情节、社会危害程度等因素，依法作出相应的处罚决定。
2. 遵循法定程序：行政处罚机关在处罚过程中，必须遵循法定的程序，包括调查取证、告知权利、听取陈述申辩、作出处罚决定等，确保处罚的公正性和合法性。

三. 实例说明

• 例如，甲公司因虚假宣传被行政处罚，而乙公司因侵犯知识产权被行政处罚。虽然两家公司都服务于同一业主单位，且业务类型不同，但行政处罚机关将分别依据甲公司的虚假宣传行为和乙公司的侵犯知识产权行为，依法对两家公司进行独立处罚，而不会因为它们服务于同一业主单位而有所偏袒或连带处罚。

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