未成年犯罪案底由公安机关、人民检察院、人民法院以及司法行政机关负责封存。

具体来说，根据《中华人民共和国刑事诉讼法》的相关规定，对于未成年人涉嫌刑法分则第四章、第五章、第六章规定的犯罪，可能判处一年有期徒刑以下刑罚，符合起诉条件，但有悔罪表现的，人民检察院可以作出附条件不起诉的决定。在附条件不起诉的考验期内，未成年犯罪嫌疑人应遵守相关规定。考验期满，人民检察院应当根据其表现情况，决定是否起诉。同时，对于被判处五年有期徒刑以下刑罚的未成年人，其相关犯罪记录应当予以封存。这一封存工作由公安机关、人民检察院、人民法院以及司法行政机关共同负责。

封存犯罪记录的目的是为了保护未成年人的合法权益，避免其因犯罪记录而受到不必要的歧视和影响。需要注意的是，犯罪记录封存并不是消灭犯罪记录，而是对犯罪记录进行保密处理，除司法机关因办案需要或有关单位根据国家规定进行查询外，不得向任何单位和个人提供。

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