在非法吸收公众存款罪中，被告人以自有资金投入公司的情况，关于这部分资金是否计算到非吸总金额中，我给出如下解答：
结论前置：在非法吸收公众存款罪中，被告人自己投入的资金，一般应计入非法吸收公众存款的总额中。但在量刑时，这部分资金可能会作为酌定从轻处罚的一个因素予以考虑。
分析说明：
法律原则：非法吸收公众存款罪侵犯的是国家金融管理秩序和公众财产权益，其犯罪数额通常是指非法吸收的他人资金总额。然而，在司法实践中，被告人自身投入的资金也往往被视为非法吸收公众存款行为的一部分，因为这部分资金同样参与了非法吸收公众存款的活动，扰乱了金融秩序。
量刑考虑：尽管被告人自己投入的资金在犯罪数额认定时通常会计入总额，但在量刑时，法院可能会考虑被告人自身也是投资者的这一情况，作为酌定从轻处罚的一个因素。这是因为，与完全将他人资金非法吸收的情况相比，被告人自身投入资金可能表明其主观恶性相对较小，或者在某种程度上受到了欺骗。
特殊情况：需要注意的是，如果被告人投入资金存在特殊情况，比如为了维系资金链运转、在意识到犯罪行为后为弥补损失而投入等，且有证据能证明其主观目的并非单纯追求非法收益，那么在司法实践中可能会结合具体案情进行综合判断，在认定犯罪金额时可能会有不同考量。
综上所述，非法吸收公众存款罪中，被告人自己投入的资金一般应计入非法吸收公众存款的总额中。但在量刑时，法院会根据具体情况酌情考虑这部分资金对被告人刑事责任的影响。如果你对此类问题有进一步的疑问或需要更详细的法律建议，请直接向我咨询。