员工将电瓶车停放室内被开除，这一行为的合法性取决于公司的规章制度以及劳动合同中的相关约定。

1. 公司规章制度与劳动合同约定：

   • 若公司在其规章制度中明确规定了电瓶车不得停放室内，且该规章制度已经过合法程序制定并公示，同时劳动合同中也对此有相应约定，那么公司依据此规定开除员工，在程序上可能是合法的。
   • 若公司规章制度或劳动合同中并未明确禁止电瓶车停放室内，或者虽然禁止但未经合法程序制定或公示，那么公司以此为由开除员工，则可能构成违法解除劳动合同。

2. 法律后果：

   • 如果公司开除员工的行为被认定为合法，那么员工可能需要承担因违反公司规章制度而导致的劳动关系终止的后果。
   • 如果公司开除员工的行为被认定为违法，那么员工有权要求公司继续履行劳动合同，或者要求公司支付违法解除劳动合同的赔偿金。

3. 建议：

   • 对于员工而言，在入职前应仔细阅读并了解公司的规章制度和劳动合同内容，确保自己的行为符合公司规定。
   • 对于公司而言，应制定合法、合理、明确的规章制度，并经过合法程序制定和公示，以确保在员工管理中有法可依。

综上所述，员工将电瓶车停放室内被开除的合法性，需要根据公司的规章制度、劳动合同约定以及相关法律法规进行综合判断。如有具体法律问题，可直接向我咨询。