法院变更法律关系，在未经当事人同意的情况下，是违法的。下面我将详细解释这一结论：

在民事诉讼中，法院的角色是中立的裁判者，其职责是根据当事人提供的证据和法律规定来作出判决。当事人主张的法律关系性质或民事行为的效力，是法院审理案件的重要依据。如果法院在审理过程中发现当事人主张的法律关系与法院根据案件事实作出的认定不一致，应当如何处理呢？

根据最高人民法院的相关规定，当出现这种情况时，法院应当告知当事人可以变更诉讼请求。这是因为，如果法院擅自改变当事人的诉讼请求并据此作出判决，就属于“未诉而判”，违反了民事诉讼法中“不告不理”的基本原则。这样的做法不仅代当事人行使了起诉的权利，还剥夺了对方当事人的抗辩权利，违反了人民法院审理民事案件的法定程序，构成程序违法。

进一步来说，如果法院在当事人未变更诉讼请求的情况下，直接对当事人未予主张的法律关系进行裁判，那么这样的判决是可以被上诉法院依法撤销的。因为这样的判决违反了法定程序，损害了当事人的合法权益。

综上所述，法院在变更法律关系时，必须得到当事人的同意。如果法院未经当事人同意就擅自变更法律关系并作出判决，那么这样的判决是违法的，当事人有权提起上诉并要求撤销该判决。因此，法院在审理案件时，应当严格遵守法定程序，尊重当事人的诉讼权利，确保判决的合法性和公正性。