代孕医院不能合法地给代孕子女发放出生证明。以下是详细分析：

一. 代孕行为的法律禁止

1. 法律明文规定：根据原卫生部颁布的《人类辅助生殖技术管理办法》，明确禁止医疗机构和医务人员实施任何形式的代孕技术。该办法规定，禁止以任何形式买卖配子、合子、胚胎，医疗机构和医务人员不得实施任何形式的代孕技术。

2. 伦理与法律原则：代孕行为在生物学和伦理学上存在母亲身份的复杂性，直接违反了相关管理办法的伦理原则，也违反了我国法律对于婚姻家庭关系和生命伦理的基本规定。

二. 出生证明的法律依据与发放条件

1. 法律依据：出生证明的发放主要依据《中华人民共和国户口登记条例》和《中华人民共和国民法典》的相关规定。其中，《中华人民共和国民法典》第十五条明确规定，自然人的出生时间和死亡时间，以出生证明、死亡证明记载的时间为准。

2. 发放条件：出生证明通常是在合法婚姻关系下，由具有助产技术服务资质的医疗保健机构在新生儿出生后签发。代孕行为本身违法，因此代孕医院无法基于合法的基础为代孕子女签发出生证明。

三. 代孕子女权益的保护与出生证明的获取

1. 孩子权益保护：虽然代孕行为违法，但孩子是无辜的，其合法权益应受到保护。对于代孕子女的出生证明问题，法律上并未明确规定具体的解决方案。

2. 实际情况处理：在实际操作中，如果代孕行为已经发生且孩子已经出生，委托夫妇可能面临无法直接获取合法出生证明的困境。这种情况下，建议咨询专业律师或相关部门，寻求合法合规的解决方案。

我的观点：代孕医院不能合法地给代孕子女发放出生证明。代孕行为本身违法，因此无法基于合法的基础为代孕子女签发出生证明。对于代孕子女的出生证明问题，需要寻求合法合规的解决方案，以保护孩子的合法权益。如有进一步需要，您可以继续咨询我。