乡村医生在合法医疗机构执业不构成非法行医罪。以下是对此结论的详细分析：

一. 合法资质与执业地点

1. 合法资质：乡村医生若持有有效的乡村医生执业证书或执业（助理）医师资格，并在卫生行政部门注册，则具备合法的行医资质。这是判断其是否构成非法行医罪的重要前提。

2. 执业地点：乡村医生在其注册的合法医疗机构内执业，即在其被聘用的村医疗卫生机构或经过合法注册的其他医疗机构内提供医疗服务，是符合法律规定的。

二. 非法行医罪的构成条件

1. 主体要求：非法行医罪的主体为未取得医生执业资格的人。而持有有效乡村医生执业证书或执业（助理）医师资格，并在合法医疗机构执业的乡村医生，显然不符合这一主体要求。

2. 行为特征：非法行医罪表现为擅自从事医疗活动，且未取得合法行医资质。在合法医疗机构执业的乡村医生，其行医行为是得到卫生行政部门认可和监管的，因此不构成擅自从事医疗活动。

三. 法律依据

• 根据《中华人民共和国医师法》及《乡村医生从业管理条例》的相关规定，乡村医生在取得合法资质并注册后，有权在聘用的村医疗卫生机构从事预防、保健和一般医疗服务。
• 《最高人民法院关于审理非法行医刑事案件具体应用法律若干问题的解释》也明确了非法行医罪的构成条件，其中并未将合法医疗机构内执业的乡村医生纳入其中。

综上所述，乡村医生在合法医疗机构执业不构成非法行医罪。他们具备合法的行医资质，且在指定的医疗机构内提供医疗服务，符合法律法规的要求。因此，对于乡村医生在合法医疗机构执业的行为，应给予充分的法律保障和认可。