事业单位是否会处分员工2012年9月之前的吸毒记录和不起诉记录，取决于具体的单位规定以及相关法律法规。以下是对此问题的详细分析：

1. 单位规定：

   • 事业单位通常有其内部的管理规定和纪律要求，这些规定可能涉及员工的品行、道德以及违法违纪行为的处理。
   • 如果单位规定中明确将吸毒或涉及刑事（即使是不起诉）作为违纪行为，并规定了相应的处分措施，那么单位有权依据这些规定对员工进行处分。
   • 但需要注意的是，单位规定必须合法，不能违反国家法律法规的规定。

2. 法律法规：

   • 根据我国相关法律法规，吸毒是违法行为，但不起诉记录并不等同于犯罪记录，它可能表示检察机关认为没有足够的证据起诉或者基于其他考虑决定不起诉。
   • 对于吸毒记录，如果单位认为它影响了员工的品行或工作能力，且符合单位规定和法律法规，可以进行相应的处分。
   • 对于不起诉记录，由于其并不直接代表员工有罪，单位在处分时应更加谨慎，需要综合考虑员工的具体情况、单位规定以及法律法规的要求。

3. 实际情况分析：

   • 如果员工的吸毒记录发生在2012年9月之前，且之后没有再次发生类似行为，单位在处分时应考虑员工是否已经改正错误、是否对工作造成了实际影响等因素。
   • 对于不起诉记录，单位应重点考虑检察机关不起诉的原因、员工是否涉及其他违法行为以及这些行为是否与工作相关等因素。

综上所述，事业单位是否会处分员工2012年9月之前的吸毒记录和不起诉记录，需要综合考虑单位规定、法律法规以及员工的实际情况。如果员工对此有疑问或担忧，建议咨询单位的人事部门或法律顾问，以获取更具体的指导和帮助。同时，我也愿意为你提供进一步的法律咨询，帮助你更好地理解和处理这个问题。