工商部门在认定格式条款时，主要依据相关法律法规和规章，以及格式条款的具体内容和表现形式。以下是对格式条款认定过程的详细解答：
一、格式条款的定义
格式条款是指经营者为了重复使用而预先拟定，并在订立合同时未与消费者协商的条款。这些条款通常是以标准化、统一化的形式出现，旨在提高交易效率，但也可能因此损害消费者的合法权益。商业广告、通知、声明、须知、店堂告示、说明、凭证等，如果其内容符合要约规定和格式条款的定义，也视为格式条款。
二、认定依据
法律法规：
- 《中华人民共和国民法典》第四百九十六条规定，采用格式条款订立合同的，提供格式条款的一方应当遵循公平原则，并采取合理的方式提示对方注意与其有重大利害关系的条款。
- 《中华人民共和国消费者权益保护法》第二十六条规定，经营者在经营活动中使用格式条款的，应当以显著方式提请消费者注意与消费者有重大利害关系的内容，并按照消费者的要求予以说明。
- 其他相关法律法规，如《合同行政监督管理办法》等，也对格式条款的使用和监管作出了具体规定。
规章：
- 地方性规章，如《江西省合同格式条款监督办法》，对格式条款的制定、使用、监督等方面进行了详细规定。这些规章通常结合当地实际情况，对法律法规进行细化和补充。
具体内容：
- 工商部门在认定格式条款时，会仔细审查条款内容是否违反法律法规和规章的规定，特别是是否损害消费者的合法权益。
- 重点关注格式条款中是否含有免除或减轻经营者责任、加重消费者责任、排除或限制消费者权利等不公平、不合理的规定。
表现形式：
- 工商部门还会审查格式条款的表现形式，如是否以显著方式提请消费者注意，是否采用了字体加粗、弹窗等显著方式。
- 对于以通知、声明、店堂告示等方式出现的格式条款，也会根据其内容和形式进行综合判断。
三、认定程序
- 受理投诉或举报：工商部门通常会通过受理消费者的投诉或举报来发现可能的格式条款问题。
- 调查取证：在受理投诉或举报后，工商部门会进行调查取证，包括收集相关合同文本、询问当事人等。
- 审查判断：根据收集到的证据和法律法规的规定，工商部门会对格式条款进行审查判断，确定其是否合法合规。
- 处理决定：对于违反法律法规和规章的格式条款，工商部门会依法作出处理决定，如责令改正、罚款等。
四、注意事项
- 遵循原则：经营者在制定和使用格式条款时，应当遵循公平、自愿、平等、诚信等原则，确保消费者的合法权益不受损害。
- 显著提示：对于与消费者有重大利害关系的条款，经营者应当以显著方式提请消费者注意，并按照消费者的要求予以说明。
- 避免违规：经营者应避免在格式条款中含有违反法律法规和规章的内容，特别是不要利用格式条款损害消费者的合法权益。
综上所述，工商部门在认定格式条款时，会综合考虑法律法规、规章、具体内容和表现形式等多个方面，以确保消费者的合法权益得到保护。同时，经营者也应当遵守相关法律法规和规章的规定，合理制定和使用格式条款。